I Kalix kommun finns åtta kommunala grundskolor samt Kulturskola. Sju av dessa är F-6-skolor, med elever från förskoleklass till skolår 6. En, Manhemsskolan, är en 7-9-skola. Varje rektorsområde har sin egen profil.
Kalix kommuns rektorsområden omfattar familjedaghem, förskolor, fritidshem, grundskolor och grundsärskolan. Eleverna väljer fritt vilken skola de vill gå i. De flesta elever väljer i dag skola efter bostadsort.
Manhemsskolan, Centrumskolan och skolorna i Näsbyn, Djuptjärn och Innanbäcken ligger i centralorten. I närhet till dessa finns förskolor.
Töre, Ytterbyn och Sangis är byar som har varsin skola. I dessa byar finns också förskolor. Till detta kommer också förskolor i byarna Vitvattnet, Morjärv, Grytnäs och Karlsborg. I Kalix kommun finns även privata förskolor i Ryssbält, Pålänge, Bondersbyn samt Lilla Miraklets förskola och Norrskenets förskola i centrala Kalix.
Grundsärskolan ligger i centrala Kalix i anslutning till Centrumskolan och Manhemsskolan.